70 000 rūšių genomų sekos nustatymas gali paskatinti naujus žmogaus gydymo būdus: lęšį

70 000 rūšių genomų sekos nustatymas gali paskatinti naujus žmogaus gydymo būdus: lęšį

Tyrėjai teigia, kad naujai sekvenuotas Kanados lūšies genomas suteikė užuominų apie tai, kaip Šiaurės Amerikos laukinės katės prisitaiko arba neprisitaiko prie klimato kaitos.

Keithas Williamsas / „Flickr“.


Slėpti pavadinimą

Perjungti pavadinimą

Keithas Williamsas / „Flickr“.


Tyrėjai teigia, kad naujai sekvenuotas Kanados lūšies genomas suteikė užuominų apie tai, kaip Šiaurės Amerikos laukinės katės prisitaiko arba neprisitaiko prie klimato kaitos.

Keithas Williamsas / „Flickr“.

Pastangos suprasti visą daugiau nei 70 000 žinduolių, paukščių, roplių, varliagyvių ir žuvų genetinę sandarą padarė didelę pažangą. Mokslininkai atskleidė 25 rūšių DNR sekas, įskaitant Kanados lūšį, plekšnį ir dantytą ungurį.

Dar svarbiau, šią savaitę paskelbtose ataskaitose gamta Kituose žurnaluose ir kituose žurnaluose tyrėjai parodė, kad jų strategija, skirta nustatyti gyvūnų DNR sekas, gali duoti aukštos kokybės rezultatus su daug mažesniu klaidų lygiu nei ankstesni metodai.

Rokfelerio universiteto tyrinėtojas Erichas Jarvisas teigė, kad patobulinti įrankiai atskleidžia genus ir net ištisas chromosomas, kurios anksčiau buvo nepastebėtos. Pasirodo, zebriniai kikiliai – pagrindiniai paukščių giesmininkai, padedantys suprasti paukščius ir mokytis žmogaus balso – turi septyniomis chromosomomis daugiau, nei manyta anksčiau. Pavyzdžiui, plekšnė turi aštuonias.

“Žmonės mano, kad paukščiams ir plekšnėms trūksta šių genų, tiesa? Tačiau jų netrūksta. Tiesiog jie nebuvo sekvenuoti naudojant senas technologijas”, – sakė Jarvis, stuburinių genomo projekto, kurį sudaro šimtai žmonių, pirmininkas. Mokslininkai yra pasiryžę sukurti visas genetines sekas kiekvienam iš 71 657 pavadintų stuburinių gyvūnų, kurie šiandien yra gyvi.

Naujasis genų sekos nustatymo įrankis rodo, kad zebrinis kikilis turi 7 chromosomomis daugiau, nei manyta anksčiau. Sportiškos rūšys visada buvo svarbus paukščių giesmininkų ir žmonių garso mokymosi modelis.

Aftab Uzzaman / Flickr


Slėpti pavadinimą

Perjungti pavadinimą

Aftab Uzzaman / Flickr


Naujasis genų sekos nustatymo įrankis rodo, kad zebrinis kikilis turi 7 chromosomomis daugiau, nei manyta anksčiau. Sportiškos rūšys visada buvo svarbus paukščių giesmininkų ir žmonių garso mokymosi modelis.

Aftab Uzzaman / Flickr

Šis darbas prasidėjo G10K konsorciume 2009 m., siekiant suskirstyti 10 000 stuburinių rūšių genomus, kad būtų galima geriau suprasti jų biologiją ir jų raidą. Pastaraisiais metais tobulėjant technologijoms ir mažėjant sąnaudoms, mokslininkų tikslai tapo ambicingesni. Galiausiai projektas tikisi kas savaitę sekvenuoti 125 rūšių genomus. Jarvisas dabar pasakė: „Mes tai darome šešis kartus per savaitę“.

Svarbu tai, kad jų strategija atskiria iš motinos paveldėtas chromosomas nuo chromosomų, paveldėtų iš tėvo. „Prieš tai beveik visi genomo surinkimo metodai turėjo sujungti tėvų chromosomas į vieną“, – sakė Jarvis, paaiškindamas, kad tai sukurs papildomo geno, kurio iš tikrųjų nebuvo, iliuziją.

Pavyzdžiui, ankstesni „meilės hormono“ oksitocino receptorių tyrimai klaidingai nustatė papildomus šių receptorių genus skirtingose ​​gyvūnų linijose, „nes prakeiktas genomo surinkėjas neatskyrė mamos ir tėčio DNR“, – sakė Jarvis. „Taigi manome, kad visose šiose giminėse turime daugiau genų, nei iš tikrųjų turime dėl klaidingų dubliavimosi.

Kopenhagos universiteto mokslininkas Zhang Guojie teigė, kad motinos ir tėvo DNR peržiūra atskirai leidžia mokslininkams sukurti išsamesnes marmozečių, kurios yra svarbios laboratorinės beždžionės, naudojamos neurodegeneracinėms smegenų ligoms tirti, genetines sekas.

“Dabar mes sukūrėme labai išsamų genomą”, – sakė Zhang. Jo komanda ištyrė 2533 genus, susijusius su smegenų vystymusi ir ligomis, ir nustatė, kad dauguma genų yra labai panašūs tarp žmonių ir marmozečių. Tačiau dešimtys rodomų skirtumų gali būti žmonių ir tokių eksperimentinių gyvūnų smegenų skirtumų pagrindas.

Į naujai paskelbtą genomą taip pat įtrauktos laukinės rūšys, kurioms šiuo metu gresia pavojus, pvz., labai nykstanti pelėda Naujojoje Zelandijoje ir Kanados lūšys, kuri Jungtinėse Valstijose yra įtraukta į nykstančių rūšių sąrašą. Lūšis, kurios DNR buvo panaudota genomui sukurti. buvo atsitiktinai užfiksuotas Niujorko valstijos universitete. Stony Brook universiteto doktorantė Tanya Lama sakė, kad jį užfiksavo kailinių gaudytojas Meine ir paleistas su radijo apykakle. „Jis vis dar ten, jam gerai sekasi“, – sakė Lama. – Jis nežinojo, kad yra garsus.

Ji sakė, kad lūšies genomas suteikė užuominų apie tai, kaip rūšis prisitaiko arba neprisitaiko prie klimato kaitos, nes jos DNR įrodymai rodo, kad jos cirkadinio ritmo genus reguliuoja šviesa.

“Šviesaus ir tamsaus laiko kiekis paroje iš tikrųjų gali būti pagrindinis aplinkos užuominas, kuris tam tikru mastu skatina lūšių cirkadinį ir cirkadinį ritmą”, – sakė Lama, kuri nurodė, kad Meino priežastis gali būti klimato kaita. šilčiau ir lietingiau, nedarant įtakos lūšių skaičiui. Dienos metu lūšių patelės gali atsivesti kačiukų, „kai sąlygos iš tikrųjų nėra idealios“.

Tai įdomus užuominas, kurį laukinės gamtos apsaugos ekspertai gali gauti turėdami visą genomą. Nors visų stuburo organizmų sekos nustatymo kaina gali siekti 100 milijonų JAV dolerių, Jarvisas mano, kad verta „sugauti visas nykstančias rūšis, sugauti visus stuburinius gyvūnus žemėje ir tapti nauju genomo atlikimo modeliu“. “

Leave a Comment

Your email address will not be published.